از چالش‌های جدی دولت جدید، وجود یک جریان اپوزیسیون داخلی از کارگزاران، اصلاحات و اعتدال گرفته تا برخی اصولگرایان است که حامی و مدافع دولت روحانی بوده‌اند.
طبیعی است که دولت جدید هرچقدر انقلابی عمل کند مخالفت، فشار و تخریب از طرف این اپوزیسیون بیشتر خواهد شد.